GDIS es un programa que renderiza y permite manipular moleculas aisladas y sistemas periódicos. Está orientado a la visualización de sistemas moleculares y periódicos. También actúa como un interfaz con paquetes externos de computación que permiten realizar cálculos de minimización de energía y otras tareas, aumentando sus posibilidades: POVRay, GULP, cdd, SgInfo, GPeriodic y Babel. Soporta varios tipos de ficheros: CIF, BIOSYM, XYZ, XTL, MARVIN y GULP. Con gtkglarea puede renderizar usando OpenGL.
La principal manera de utilizar GDIS es cargar alguna estructura(s). Una vez se hace clic en el icono de “Abrir modelo” o se selecciona la opción de menú es seleccionada, se muestra una caja de diálogo para navegar por las carpetas. Por defecto, se muestran todos los tipos de archivos soportados por GDIS.En la esquina inferior derecha se puede filtrar el tipo de fichero deseado.
Los archivos pueden ser cargados haciendo doble clic sobre su nombre, o seleccionando el archivo (un clic) y seleccionando el botón . También puede escribirse directamente el nombre del archivo. La extensión del archivo es obligatoria para determinar el tipo de formato y debe estar siempre presente al cargar y guardar archivos.
GDIS está diseñado para ser utilizado con un ratón de tres botones, aunque con uno con dos también puede utilizarse sin problemas.
El botón izquierdo del ratón se usa para seleccionar subconjuntos de elementos de un modelo. Esto se consigue haciendo clic sobre los átomos, en cuyo caso se muestra información de los átomos seleccionados en la zona de propiedades del átomo situada en el panel izquierdo de la ventana principal.
También se puede seleccionar átomos si se mantiene presionado el botón izquierdo y se arrastra el ratón. Haciendo clic en una zona vacía de la ventana de visualización, limpia la selección. Los átomos seleccionados pueden eliminarse presionando la tecla Supr o con la opción de menú . Los átomos seleccionados también pueden cortarse y pegarse en otros modelos, ser ocultados, o modificar su color mediante la opción adecuada del menú Edit.
La acción por defecto cuando se pulsa el botón central y se arrastra el ratón, es mover el modelo en su conjunto. Si se mantiene presionada la tecla Ctrl, sólo se moverán los átomos seleccionados. Si se mantiene presionada la tecla May, se hará un zoom sobre el modelo.
Arrastrar con el botón derecho de ratón, rotará todo el modelo. El movimiento del ratón en la dirección x e y produce una rotación sobre dos de los tres ejes espaciales. Si se mantiene presionada la tecla May, la rotación se realizará sobre el tercer eje. Si se mantiene presionada la tecla Ctrl, sólo se rotarán los átomos seleccionados.
Por defecto, GDIS funciona en modo normal. El comportamiento de este modo se describe en la sección anterior de Interacción básica. Sin embargo, GDIS puede funcionar en otros modos interactuando de forma distinta con el ratón. El modo de funcionamiento siempre se muestra en la esquina inferior derecha de la ventana. También se puede volver al modo normal de funcionamiento haciendo clic en el icono de la barra de herramientas.
Cuando se selecciona la opción de menú , se muestra una nueva caja de diálogo. Para ello debe haber cargado un modelo o crearse uno nuevo ().
Dos de los botones de la pestaña Objects son para añadir y eliminar átomos. Para añadir átomos: hacer clic sobre el botón , luego dirigirse a la ventana de trabajo e ir haciendo clic para añadir átomos al modelo. Cuando se añaden átomos, puede usarse el panel de propiedades del átomo para modificar el elemento, cargarlo y cambiar su posición.
La opción de menú muestra la caja de diálogo Mediciones (measurements). Si uno de los modos manuales es seleccionado, se cambiará el modo de funcionamiento correspondiente. Sin embargo, el modo también indicará que espera que sean especificados un cierto número de átomos para realizar la operación.
Por ejemplo, si se selecciona la medición de ángulos (measure angles), el modo reflejará cuántos átomos se han seleccionado y cuántos son necesarios en total. Cuando se selecciona el número de átomos requerido, la medida se lleva a cabo y se muestra en la caja de diálogo y en la ventana de visualización.
Las mediciones pueden eliminarse haciendo clic en su entrada en la caja de diálogo y seleccionando el botón . Si se selecciona el nombre del modelo en la caja de diálogo de ediciones, al pulsar en Eliminar se eliminarán todas las mediciones.